Se encarga de la liquidación de haberes con fondos presupuestales y de libre disponibilidad, cálculos de sueldos, Historia Laboral, Mantenimiento de la estructura de cargos docentes y TAS,  e Informes de Expedientes entre otros, solicitados por la Dirección, cómo así también la atención a docentes y funcionarios TAS.

Le corresponde el manejo y control de los fondos provenientes de pagos y recaudaciones de las distintas financiaciones de la Facultad. La habilitación en relación al manejo de fondos y valores, cómo así también de descuentos particulares a todos los funcionarios de la institución y su respectivo control. A su vez tiene a cargo la Cabina de Recaudación del Centro Hospital Veterinario, en el más amplio de los sentidos que ello conlleva.

La Unidad de Control Presupuestal y Fondos de Libre Disponibilidad tiene como cometido la gestión y control en su amplio sentido y globalidad de: Fondos Presupuestales y Fondos de Libre Disponibilidad en todos sus programas, proyectos, donaciones, etc. El control de legalidad del gasto, el seguimiento y rendición de los Proyectos Centrales, Plan de Obras, y los diferentes fondos de libre disponibilidad de la Institución, las rendiciones en SIIF y en el Sistema Nacional de Inversión Pública, entre otros. Seguimiento y Proyección de Ejecución, cómo así también el Cupo Financiero. Apertura y Cierre Presupuestal y Fondos de Libre Disponibilidad.

Le corresponde el ingreso de la documentación en la ejecución de los gastos e inversiones de la Facultad, con fondos presupuestales y de libre disponibilidad. Es la encargada de la documentación de las rendiciones de los docentes bajo el régimen de Dedicación Total. Realiza la carga de Combustible a través del SISCONVE y control de los fondos de los diferentes tipos de Combustible en la Institución.

Se encarga de la registración de todos los movimientos económicos de la Facultad, así como la aplicación de procedimientos de control estipulados por la UdelaR y el TCR. Proyectos ANII, rendiciones de: partidas de fondos, rendición de recaudación, de donaciones y de remuneraciones en todo su proceso, de acuerdo a la normativa vigente y exigencias centrales de Udelar. Arqueos y Conciliaciones Bancarias.